Echobase

Présentation

L'Institut Français pour l'Exploration de la Mer (Ifremer) fournit une suite de logiciels libres pour stocker des données collectées lors de campagnes halieutiques intégrées ou par des observatoires fixes (mouillages), et calculer des indicateurs sur la base de ces données. L'objectif est de contribuer à la mise en place de systèmes de surveillance des écosystèmes marins alimentés par des observations scientifiques à la mer. La suite logicielle comprend une base de données postgreSQL dédiée au stockage des métadonnées, données acoustiques et de pêche issues de campagnes écosystémiques ou de mouillages (Echobase) et de codes R (EchoR) permettant de produire et d'analyser des indicateurs et des cartes renseignant sur l'état des populations d'organismes marins, à partir des données stockées dans Echobase. Ce site décrit la base de données Echobase.

Les caractéristiques d'Echobase incluent :

  • une interface basée accessible via un navigateur internet pour importer, éditer et extraire des données ;
  • une grande capacité de stockage et un système de gestion de bases multiples ;
  • une intégration facile avec des Systèmes d'Information Géographiques et ou des sites internet dynamiques ;
  • une structure de métadonnées acoustiques en accord avec le format défini par le groupe de travail CIEM WGFAST.

Des codes permettant d'exporter et importer des données vers/de EchoBase sont disponibles dans le package R EchoR.